MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017227	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017227	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017227	A	6	6	60	65	100 %	0 %	0 %	0 %	384206107
5	NC_017227	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206107
6	NC_017227	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206107
7	NC_017227	T	6	6	134	139	0 %	100 %	0 %	0 %	384206107
8	NC_017227	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206107
9	NC_017227	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
10	NC_017227	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206107
11	NC_017227	TTGATT	2	12	414	425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206107
12	NC_017227	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
13	NC_017227	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
14	NC_017227	T	6	6	559	564	0 %	100 %	0 %	0 %	384206107
15	NC_017227	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	384206107
16	NC_017227	T	6	6	628	633	0 %	100 %	0 %	0 %	384206107
17	NC_017227	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206107
18	NC_017227	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206107
19	NC_017227	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206107
20	NC_017227	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
21	NC_017227	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
22	NC_017227	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	384206107
23	NC_017227	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206107
24	NC_017227	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
25	NC_017227	T	6	6	1057	1062	0 %	100 %	0 %	0 %	384206107
26	NC_017227	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206107
27	NC_017227	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206107
28	NC_017227	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206107
29	NC_017227	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206107
30	NC_017227	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206107
31	NC_017227	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206108
32	NC_017227	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206108
33	NC_017227	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206108
34	NC_017227	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206108
35	NC_017227	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206108
36	NC_017227	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206108
37	NC_017227	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206108
38	NC_017227	A	6	6	1793	1798	100 %	0 %	0 %	0 %	384206108
39	NC_017227	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206108
40	NC_017227	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206108
41	NC_017227	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206108
42	NC_017227	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	384206108
43	NC_017227	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206109
44	NC_017227	A	6	6	2048	2053	100 %	0 %	0 %	0 %	384206109
45	NC_017227	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206109
46	NC_017227	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206109
47	NC_017227	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206109
48	NC_017227	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206109
49	NC_017227	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206109
50	NC_017227	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206109
51	NC_017227	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206109
52	NC_017227	TTAT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	384206109
53	NC_017227	GTAA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	25 %	0 %	384206109
54	NC_017227	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206110
55	NC_017227	GCAG	2	8	2627	2634	25 %	0 %	50 %	25 %	384206110
56	NC_017227	CAAG	2	8	2664	2671	50 %	0 %	25 %	25 %	384206110
57	NC_017227	AGA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206110
58	NC_017227	GATTC	2	10	2709	2718	20 %	40 %	20 %	20 %	384206110
59	NC_017227	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206110
60	NC_017227	A	6	6	2748	2753	100 %	0 %	0 %	0 %	384206110
61	NC_017227	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206110
62	NC_017227	GAGC	2	8	2826	2833	25 %	0 %	50 %	25 %	384206110
63	NC_017227	AGA	2	6	2876	2881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206110
64	NC_017227	A	6	6	2897	2902	100 %	0 %	0 %	0 %	384206110
65	NC_017227	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206110
66	NC_017227	CTGATA	2	12	2971	2982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206110
67	NC_017227	ATGT	2	8	3001	3008	25 %	50 %	25 %	0 %	384206110
68	NC_017227	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206110
69	NC_017227	ATAA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	384206110
70	NC_017227	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206110
71	NC_017227	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206110
72	NC_017227	CAAT	2	8	3190	3197	50 %	25 %	0 %	25 %	384206110
73	NC_017227	AGAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	384206110
74	NC_017227	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206110
75	NC_017227	TTAAT	2	10	3262	3271	40 %	60 %	0 %	0 %	384206110
76	NC_017227	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206110
77	NC_017227	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206110
78	NC_017227	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017227	AATG	2	8	3355	3362	50 %	25 %	25 %	0 %	384206111
80	NC_017227	T	6	6	3492	3497	0 %	100 %	0 %	0 %	384206111
81	NC_017227	G	6	6	3504	3509	0 %	0 %	100 %	0 %	384206111
82	NC_017227	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206111
83	NC_017227	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206111
84	NC_017227	CCA	2	6	3697	3702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206111
85	NC_017227	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206111
86	NC_017227	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206111
87	NC_017227	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206111
88	NC_017227	GCAAA	2	10	3858	3867	60 %	0 %	20 %	20 %	384206111
89	NC_017227	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206111
90	NC_017227	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	384206111
91	NC_017227	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206111
92	NC_017227	AGG	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017227	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
94	NC_017227	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206112
95	NC_017227	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
96	NC_017227	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
97	NC_017227	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206112
98	NC_017227	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206112
99	NC_017227	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206112
100	NC_017227	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206112
101	NC_017227	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
102	NC_017227	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206112
103	NC_017227	A	6	6	4388	4393	100 %	0 %	0 %	0 %	384206112
104	NC_017227	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206112
105	NC_017227	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206112
106	NC_017227	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206112
107	NC_017227	A	6	6	4498	4503	100 %	0 %	0 %	0 %	384206112
108	NC_017227	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206112
109	NC_017227	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206112
110	NC_017227	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206112
111	NC_017227	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206112
112	NC_017227	TCAT	2	8	4832	4839	25 %	50 %	0 %	25 %	384206112
113	NC_017227	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206112
114	NC_017227	TAAAT	2	10	4924	4933	60 %	40 %	0 %	0 %	384206113
115	NC_017227	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206113
116	NC_017227	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206113
117	NC_017227	GAATTT	2	12	5193	5204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206113
118	NC_017227	A	6	6	5214	5219	100 %	0 %	0 %	0 %	384206113
119	NC_017227	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206113
120	NC_017227	TAGTGG	2	12	5255	5266	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206113
121	NC_017227	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206113
122	NC_017227	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206113
123	NC_017227	AGTG	2	8	5386	5393	25 %	25 %	50 %	0 %	384206113
124	NC_017227	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206114
125	NC_017227	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206114
126	NC_017227	ATT	2	6	5555	5560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206114
127	NC_017227	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206114
128	NC_017227	ATACT	2	10	5728	5737	40 %	40 %	0 %	20 %	384206114
129	NC_017227	GGAC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	50 %	25 %	384206114
130	NC_017227	TTGG	2	8	5792	5799	0 %	50 %	50 %	0 %	384206115
131	NC_017227	GGC	2	6	5839	5844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206115
132	NC_017227	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206115
133	NC_017227	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206115
134	NC_017227	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206115
135	NC_017227	GAAT	2	8	5957	5964	50 %	25 %	25 %	0 %	384206115
136	NC_017227	A	6	6	6061	6066	100 %	0 %	0 %	0 %	384206115
137	NC_017227	GTA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206115
138	NC_017227	TTG	2	6	6092	6097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206115
139	NC_017227	AACT	2	8	6119	6126	50 %	25 %	0 %	25 %	384206115
140	NC_017227	AAT	2	6	6216	6221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206116
141	NC_017227	ATC	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206116
142	NC_017227	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206116
143	NC_017227	TAATA	2	10	6287	6296	60 %	40 %	0 %	0 %	384206116
144	NC_017227	AT	4	8	6393	6400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206116
145	NC_017227	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206116
146	NC_017227	AATC	2	8	6513	6520	50 %	25 %	0 %	25 %	384206116
147	NC_017227	TAAA	2	8	6535	6542	75 %	25 %	0 %	0 %	384206116
148	NC_017227	TAA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206116
149	NC_017227	AGG	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206116
150	NC_017227	TGC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206117
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152	NC_017227	AATGGA	2	12	6880	6891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206117
153	NC_017227	GAAAA	2	10	6905	6914	80 %	0 %	20 %	0 %	384206117
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158	NC_017227	T	7	7	7137	7143	0 %	100 %	0 %	0 %	384206117
159	NC_017227	GAAA	3	12	7203	7214	75 %	0 %	25 %	0 %	384206117
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161	NC_017227	CAAG	2	8	7279	7286	50 %	0 %	25 %	25 %	384206117
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164	NC_017227	GAC	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206117
165	NC_017227	CTT	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206117
166	NC_017227	A	6	6	7491	7496	100 %	0 %	0 %	0 %	384206117
167	NC_017227	TTG	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206117
168	NC_017227	CTGCA	2	10	7559	7568	20 %	20 %	20 %	40 %	384206117
169	NC_017227	GTG	2	6	7574	7579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206117
170	NC_017227	ACT	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206117
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172	NC_017227	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206117
173	NC_017227	TAC	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206117
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175	NC_017227	ACA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206118
176	NC_017227	GTT	2	6	7916	7921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206118
177	NC_017227	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206118
178	NC_017227	TGCT	2	8	8085	8092	0 %	50 %	25 %	25 %	384206118
179	NC_017227	ATT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206118
180	NC_017227	GAA	2	6	8150	8155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206118
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182	NC_017227	CAG	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206118
183	NC_017227	A	6	6	8220	8225	100 %	0 %	0 %	0 %	384206118
184	NC_017227	TTA	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206119
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186	NC_017227	TTA	2	6	8491	8496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206119
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189	NC_017227	A	6	6	8564	8569	100 %	0 %	0 %	0 %	384206119
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196	NC_017227	A	6	6	8790	8795	100 %	0 %	0 %	0 %	384206120
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202	NC_017227	A	6	6	9053	9058	100 %	0 %	0 %	0 %	384206121
203	NC_017227	A	6	6	9088	9093	100 %	0 %	0 %	0 %	384206121
204	NC_017227	A	6	6	9110	9115	100 %	0 %	0 %	0 %	384206121
205	NC_017227	TTG	2	6	9348	9353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206121
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222	NC_017227	AAT	2	6	10060	10065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206121
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225	NC_017227	CAA	2	6	10123	10128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206121
226	NC_017227	AGT	2	6	10169	10174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206121
227	NC_017227	TAG	2	6	10200	10205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206121
228	NC_017227	CAT	2	6	10215	10220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206121
229	NC_017227	TAA	2	6	10233	10238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206121
230	NC_017227	TAT	2	6	10250	10255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206121
231	NC_017227	ATT	2	6	10270	10275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_017227	TAAAAA	2	12	10304	10315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206122
233	NC_017227	A	6	6	10335	10340	100 %	0 %	0 %	0 %	384206122
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235	NC_017227	T	9	9	10479	10487	0 %	100 %	0 %	0 %	384206122
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237	NC_017227	CTA	2	6	10546	10551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206122
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239	NC_017227	GTG	2	6	10624	10629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206122
240	NC_017227	AAC	2	6	10726	10731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206122
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242	NC_017227	AGT	2	6	10871	10876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206122
243	NC_017227	ATA	2	6	10907	10912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206122
244	NC_017227	ATG	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206123
245	NC_017227	GAAA	2	8	11027	11034	75 %	0 %	25 %	0 %	384206123
246	NC_017227	ATC	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206123
247	NC_017227	AT	3	6	11202	11207	50 %	50 %	0 %	0 %	384206123
248	NC_017227	A	6	6	11211	11216	100 %	0 %	0 %	0 %	384206123
249	NC_017227	A	6	6	11229	11234	100 %	0 %	0 %	0 %	384206123
250	NC_017227	TGG	2	6	11288	11293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206123
251	NC_017227	ATT	2	6	11321	11326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206123
252	NC_017227	CTT	2	6	11339	11344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206123
253	NC_017227	AACA	2	8	11357	11364	75 %	0 %	0 %	25 %	384206123
254	NC_017227	GAT	2	6	11454	11459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206123
255	NC_017227	ATA	2	6	11526	11531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206123
256	NC_017227	CATAA	2	10	11547	11556	60 %	20 %	0 %	20 %	384206123
257	NC_017227	AGA	2	6	11651	11656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206123
258	NC_017227	AAG	2	6	11683	11688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206123
259	NC_017227	TA	3	6	11720	11725	50 %	50 %	0 %	0 %	384206123
260	NC_017227	CAT	2	6	11801	11806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206123
261	NC_017227	ATA	2	6	11906	11911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206123
262	NC_017227	TA	3	6	11937	11942	50 %	50 %	0 %	0 %	384206124
263	NC_017227	AAG	2	6	11986	11991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206124
264	NC_017227	AGC	2	6	12055	12060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206124
265	NC_017227	AAG	2	6	12067	12072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206124
266	NC_017227	CA	3	6	12111	12116	50 %	0 %	0 %	50 %	384206124
267	NC_017227	A	6	6	12116	12121	100 %	0 %	0 %	0 %	384206124
268	NC_017227	TAC	2	6	12166	12171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206124
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